Với bề dày 34 năm công tác tại Đại học Y Dược TP.HCM và Bệnh viện Chợ Rẫy, Bác sĩ Nguyễn Tấn Cường có nhiều kinh nghiệm trong việc chẩn đoán và điều trị các bệnh lý về Ngoại khoa tổng quát (phẫu thuật tiêu hóa và phẫu thuật gan-mật-tụy).
Bác sĩ là người đầu tiên tại Việt Nam cắt túi mật nội soi năm 1992, là người tiên phong trong nhiều loại phẫu thuật nội soi như cắt đại tràng, cắt gan, cắt lách, cắt tụy, lấy sỏi ống mật chủ qua nội soi, phẫu thuật nội soi trong cấp cứu chấn thương bụng, nội soi lồng ngực cắt thần kinh tạng để giảm đau, cắt thần kinh giao cảm ngực trị tăng tiết mồ hôi v.v..
Đặc biệt, vào tháng 10/2012, Bác sĩ Nguyễn Tấn Cường đã cùng êkíp ghép gan Bệnh viện Chợ Rẫy phối hợp với các bác sĩ Bệnh viện ASan – Hàn Quốc thực hiện thành công ca ghép gan đầu tiên cho người lớn tại các tỉnh phía Nam và được trao giải thưởng Sao Vàng Đất Việt cho công trình này.
Bác sĩ Cường cũng xuất bản nhiều sách chuyên ngành y dành cho sinh viên và tham gia viết bài cho các tạp chí về Y học trong và ngoài nước như: Phẫu thuật Nội soi, Tạp chí của Hội Phẫu thuật Nội soi Nhật Bản, Tạp chí chuyên về Phẫu thuật, Tạp chí Y học Thực hành, Tạp chí Y học của TP.HCM, Tài liệu Y Dược TP.HCM, Tạp chí Phẫu thuật Nội soi…